Microbiota y embarazo

Estudio de la Microbiota Endometrial

Continuando con el tema de la microbiota endometrial en sus distintas facetas nos presenta Igenomix庐 dos an谩lisis para el estudio de la microbiota endometrial: EMMA庐 y ALICE庐.

Se ha visto en diferentes estudios la importancia de identificar desequilibrios en la microbiota endometrial.

Cuando existe un desequilibrio de la flora bacteriana (disbiosis) en la cavidad uterina se asocia a bajos resultados en pacientes sometidas a tratamientos de reproducci贸n asistida.

Se cree que cuando se reducen los niveles de Lactobacilos endometriales disminuye las posibilidades de embarazo ya que dejan paso a la presencia de otras bacterias patol贸gicas.

Microbiota definici贸n

Antes de entrar en materia me gustar铆a repasar algunos aspectos como el concepto de la microbiota.

La microbiota se define como el conjunto de microorganismos que colonizan el cuerpo y convive en 茅l. Estos son bacterias, hongos, virus, protozoos y levaduras.

Es variable el conjunto de microorganismos de cada zona del cuerpo siendo la de la piel diferenta a la vaginal, y esta a la del aparato urinario, sistema respiratorio o la microbiota intestinal a la que antes la llam谩bamos flora intestinal.

Microbiota Intestinal

La microbiota intestinal est谩 compuesta por unos 10 billones de bacterias, o lo que es lo mismo, 10 veces m谩s que el n煤mero de c茅lulas del cuerpo humano.

Dentro de nuestro aparato digestivo conviven las bacterias en un ecosistema especial. Al igual que en la vaginal y otras mucosas forman una biopel铆cula que las protege e impide el ser eliminadas por el aparato digestivo.

Es 煤nica para cada individuo la microbiota siendo mayor el n煤mero de bacterias en el est贸mago que al final del aparato digestivo, esto es el colon.

Tiene tres funciones que son la digesti贸n de los alimentos, hacer de barrera ante otras bacterias pat贸genas para el ser humano y estimular al sistema inmunitario.

El hablar de la microbiota intestinal es por la existencia de una relaci贸n entre esta microbiota intestinal y la del aparato genitourinario, en concreto de la microbiota vaginal y por contig眉idad de la endometrial.

Microbiota Vaginal

Al inicio de la pubertad se produce una secreci贸n vaginal rica en nutrientes que permiten el desarrollo de lactobacilos, estas producen una reducci贸n del pH y agua oxigenada, estos productos eliminan bacterias pat贸genas y controlar谩n el crecimiento excesivo de Gardnerella vaginalis, Candida albicans entre otros.

La vagina por tanto est谩 colonizada por lactobacillus. Existen m谩s de 100 especies de Lactobacillus. Viven principalmente en聽 los vegetales y las cavidades internas de los animales.

Los lactobacilos predominantes en vagina son Lactobacillus crispatus, L. iners, L. jensenii y L. gasseri.

EMMA庐 (An谩lisis Metagen贸mico del Microbioma Endometrial)

Este an谩lisis trata de determinar si el entorno microbiano del 煤tero es 贸ptimo para la implantaci贸n embrionaria.
El an谩lisis EMMA庐 nos determina聽la composici贸n bacteriana del endometrio, incluyendo aquellas bacterias 聽que causan la endometritis cr贸nica.

驴Cuando est谩 indicado realizar el an谩lisis EMMA庐?

Fallo recurrente de de implantaci贸n (RIF) y p茅rdidas recurrentes de embarazos (RPL). Puede ser beneficioso para cualquier mujer que desee ser madre, analizando el entorno microbiano que recibir谩 al embri贸n.

驴En qu茅 consiste este an谩lisis EMMA庐?

Primero se obtiene un muestra de tejido endometrial mediante una bi贸psia que se puede realizar en la consulta.

El d铆a de la bi贸psia聽se debe realizar entre los d铆as 15 y 25 en caso de ciclo natural, o durante la fase secretora en un ciclo con sustituci贸n endometrial.

En este test se utiliza la tecnolog铆a de secuenciaci贸n masiva (NGS), que proporciona informaci贸n del microbioma del tejido endometrial analizando su perfil microbiano completo.

Puede distinguir los genes de las bacterias del de los humanos presentes en el ADN extra铆do de la muestra.

驴Qu茅 nos aparecer谩 en el informe?

El informe EMMA proporcionar谩 una valoraci贸n general sobre la salud bacteriana de la cavidad uterina.
Incluye:

  • Porcentajes de Lactobacilos.
  • Abundancia (porcentaje) de las 10 bacterias m谩s representadas detectadas en la muestra endometrial.
  • El perfil bacteriano endometrial se traducir谩 en t茅rminos de microbioma normal (alto porcentaje de Lactobacilos), o anormal (bajo porcentaje de Lactobacilos y /o presencia de bacterias disbi贸ticas y pat贸genas).
  • Recomendaci贸n sobre tratamiento de probi贸ticos/antibi贸ticos en caso necesario.

El tratamiento recomendado de probi贸ticos/antibi贸ticos ser谩 guiado por un microbi贸logo cl铆nico especializado, que aconsejar谩 a la paciente o al doctor de forma personalizada.

Ventajas de la secuenciaci贸n masiva (NGS) vs el cultivo microbiano

El cultivo microbiano es el m茅todo est谩ndar utilizado actualmente para la evaluaci贸n de la poblaci贸n de bacterias y las infecciones.

Cultivo tradicional
Cultivo tradicional

Sin embargo, se ha demostrado que entre el 20% y el 60% de las bacterias, seg煤n su localizaci贸n, no pueden ser cultivadas o no se eval煤an de forma habitual en el 谩mbito cl铆nico.

La evaluaci贸n molecular del microbioma mediante NGS permite detectar tanto bacterias cultivables como no cultivables.

Secuenciaci贸n masiva
Secuenciaci贸n masiva NGS

 

ALICE庐 (Analysis of Infectious Crohonic Endometritis)

La Endometritis Cr贸nica es una inflamaci贸n persistente del endometrio, producida por una infecci贸n uterina debida a bacterias pat贸genas, por tanto por una microbiota alterada.

Generalmente la endometritis cr贸nica no da s铆ntomas.

Los m茅todos habituales de diagn贸stico (histolog铆a, histeroscopia y cultivo microbiano) no son eficaces. Por lo que la enfermedad suele pasar desapercibida a pesar de que afecta aproximadamente al 30% de las pacientes inf茅rtiles, y puede llegar al 66% de las pacientes con fallos de implantaci贸n recurrentes y abortos de repetici贸n.

ALICE庐 (Analysis of Infectious Chronic Endometritis) es un nuevo test Igenomix庐.聽 Detecta las bacterias que, de manera m谩s frecuente, causan endometritis cr贸nica, permite ampliar la evaluaci贸n del factor endometrial a nivel microbiol贸gico para mejorar el manejo cl铆nico de las pacientes con esta enfermedad asintom谩tica.

驴Cuando se indica el an谩lisis ALICE庐?

ALICE聽es beneficioso para cualquier mujer que desee ser madre, analizando el entorno microbiano que recibir谩 al embri贸n.

ALICE tambi茅n es v谩lido para pacientes con antecedentes de fallos de implantaci贸n recurrentes y abortos de repetici贸n, dado que la endometritis cr贸nica est谩 vinculada con estos hechos.

驴C贸mo se realiza el test ALICE庐?

ALICE庐 utiliza la tecnolog铆a NGS (secuenciaci贸n masiva) para proporcionar informaci贸n del microbioma de una muestra endometrial, analizando la abundancia de las bacterias que causan la endometritis cr贸nica.

La tecnolog铆a se basa en la extracci贸n del ADN bacteriano seguida por la amplificaci贸n y secuenciaci贸n del gen 16S rRNA de las bacterias que con mayor frecuencia causan la endometritis cr贸nica.

El test ALICE庐 puede diferenciar los genes bacterianos de los genes humanos presentes en el ADN extra铆do de la muestra.

El gen 16S rRNA, presente en todas las bacterias, permite la identificaci贸n y cuantificaci贸n relativa de las bacterias causantes de la endometritis cr贸nica.

驴En que muestra de tejido se realiza la prueba?

ALICE庐 se puede realizar con una peque帽a muestra de tejido endometrial, que se extrae en consulta con una peque帽a c谩nula.

驴En qu茅 d铆a se hace la bi0psia?

ALICE庐 se debe realizar entre los d铆as 15 y 25 en caso de ciclo natural, o durante la fase secretora en un ciclo hormonal sustituido.

驴Qu茅 nos dice el informe?

Si el resultado de ALICE庐 es positivo, el informe mostrar谩 los pat贸genos detectados y el porcentaje de las bacterias causantes de la enfermedad.

Estas bacterias son: Enterococcus spp., Enterobacteriaceae, Streptococcus spp., Staphylococcus spp., Mycoplasma spp. y Ureaplasma spp.

Informar谩 sobre la existencia de otras bacterias pat贸genas asociadas a enfermedades de transmisi贸n sexual (ETS), como Chlamydia y Neisseria.

Seg煤n el resultado del test, se incluir谩 un listado con los antibi贸ticos y probi贸ticos recomendados.

El tratamiento recomendado de antibi贸ticos/probi贸ticos ser谩 guiado por un microbi贸logo cl铆nico especializado, que aconsejar谩 a la paciente o el doctor de forma personalizada.

驴Cu谩les son las ventajas de la detecci贸n de pat贸genos mediante secuenciaci贸n masiva (NGS) vs los m茅todos cl谩sicos?

Los m茅todos actuales para la detecci贸n de la endometritis cr贸nica son la histolog铆a, la histeroscopia y el cultivo microbiano.

Sin embargo, estos tres m茅todos diagn贸sticos proporcionan resultados no concluyentes o confusos en el 80% de los casos.

Mientras la histolog铆a generalmente infra diagnostica la endometritis cr贸nica, la histolog铆a suele sobrediagnosticar la enfermedad.

Estos m茅todos no son capaces de identificar al pat贸geno causante, por lo que el tratamiento es de amplio espectro.

Fuentes

  • Igenomix庐
  • Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature 2012; 486:207鈥14.
  • Moreno I, Codo帽er FM, Vilella F, Valbuena D, Martinez-Blanch JF, Jimenez-Almazan J, Alonso R, Alama P, Remohi J, PellicerA, Ram贸n D, Simon C. Evidence that the endometrial microbiota has an effect on implantation success or failure. Am J Obstet Gynecol. 2016; 215:684-703.
  • Moreno I, Codo帽er FM, Vilella F, Valbuena D, Martinez-Blanch JF, Jimenez-Almazan J, Alonso R, Alama P, Remohi J, PellicerA, Ram贸n D, Simon C. Evidence that the endometrial microbiota has an effect on implantation success or failure. Am J Obstet Gynecol. 2016; 215:684-703.
  • Moreno I, CicinelliE, Garcia-Grau I, Gonz谩lez M, BauD, Vilella F, De Ziegler D, RestaL, Valbuena D, Simon C. The diagnosis of chronic endometritis in infertile asymptomatic women: a comparative study of histology, microbial cultures, hysteroscopy, and molecular microbiology. Am J Obstet Gynecol. 2018.
  • Cicinelli et al., Chronic endometritis due to common bacteria is prevalent in women with recurrent miscarriage as confirmed by improved pregnancy outcome after antibiotic treatment. Reprod Sci 2014; 21(5):640-7.
  • Cicinelli et al., Prevalence of chronic endometritis in repeated unexplained implantation failure and the IVF success rate after antibiotic therapy. Hum Reprod, 2015; 30(2):323-30.

18 comentarios en “Estudio de la Microbiota Endometrial”

  1. Hola ! Gracias por la publicaci贸n! REcomienda alg煤n laboratorio donde se pueda realizar en Espa帽a?

    Es de agradecer un ginec贸logo que le de la importancia que merece la microbiota.

    Gracias. Un saludo

  2. Buenas tardes, en mi ciclo anterior me realic茅 un test de microbiota y ha salido gardnerella y atopobium. Me han prescrito cloruro de decualinio vaginal y metronidazol oral junto con probi贸ticos orales y vaginales. Mi doctor quiere hacerme la transferencia en este ciclo sin repetir la biopsia porque considera que es mejor realizarlo cerca del tratamiento con antibi贸tico por si hay recidiva. 驴No ser铆a mejor repetir la biopsia y asegurar que han desaparecido las bacterias y recuperado la microbiota en lugar de asumir que basta con un 煤nico tratamiento? Gracias.

    1. Buenos d铆as, la repetici贸n de la prueba suele indicarla el laboratorio que realiza el test, no siempre es necesario y tu m茅dico tendr谩 su criterio seg煤n tu caso. A priori la repetici贸n nos saca de dudas sobre la curaci贸n o no.
      Un saludo.

  3. Hola! Acabo de recibir mis informes del test endomeTRIO y me pone que tengo 91,86%lactobacillus, 7,01%staphylococcus, y 1,13% otros.
    Me dicen que es normal y que no hay endometritis, que no necesito tratamiento.
    Me preocupa que haya un 7% de staphylococcus, ya que son bacterias patogenas, el resto de patogenos no se han detectado.
    Hoy me realice tambien una histeroscopia y se veian en e帽 fondo uterino imagenes hiperemicas y algunos puntos sangrantes, puede darme el cultivo positivo?? Aun siendo ALICE negativo?

    1. Buenos d铆as, que predominen lactobacillus > 90 % hace que exista un ambiente favorable para la implantaci贸n embrionaria. Pueden aparecer otras bacterias pat贸genas pero en cantidades muy peque帽as sin tener repercusi贸n. Los resultados los revisan en Igenomix y en el informe indican si es necesario o no tratamiento.
      La histeroscopia sabemos que es menos precisa su relaci贸n entre lo que vemos y la presencia de infecci贸n.
      Podr铆a dar el cultivo positivo, es menos preciso.
      De cualquier manera las pruebas en general del tipo que sean tienen un porcentaje de falsos positivos y negativos.
      Un saludo.

  4. Buenas tardes,
    Tras tres transferencias por ovodonacion con balastos de calidad A, dos bioqu铆micos y un negativo, no estoy segura de hacer el test Emma y Alice ya que me han analizado CD138 y no tengo endometriosis ni endometritis.
    Usted cree que es recomendable hacerlo?? Pueden cambiar los resultados de ahora al siguiente ciclo??
    La 煤ltima transferencia tom茅 lactobacilles por si a caso.
    Muchas gracias por su respuesta.

    1. Buenos d铆as Sio, aunque los CD 138 sean negativos no quiere decir que no tengas una endometritis ya que es una prueba menos precisa que el test ALICE, el testa EMMA te va a contar como est谩 tu microbiota, con lo que tu m茅dico tendr谩 m谩s informaci贸n cara al tratamiento. De cualquier forma, para poder hacer una indicaci贸n de pruebas, etc. se necesita conocer todo el caso.
      Un saludo.

  5. Buenas tardes, muchas gracias por toda la informaci贸n proporcionada. Tengo una duda y ojal谩 me pueda aclarar鈥 en febrero hice el test EndomeTRIO y la parte del Emma sali贸 con un 100% bacterias malas (0 lactobacillus). Tras 10 dias de antibi贸ticos pautados y un mes de probi贸ticos (oral y vaginal) me toca repetir la biopsia pero no entiendo por qu茅 esta vez me lo hacen en d铆a 23 del ciclo y hoy a d铆a 12 tuve que pincharme ovitrelle. Por qu茅 el ovitrelle? El 15 adem谩s a帽ado progesterona hasta el d铆a de la biopsia鈥 me ayuda a entender esta pauta por favor? Anteriormente no fue la misma y por eso las dudas. Mil gracias de antemano

    1. Buenas tardes Ana, lo mejor es que te lo aclare tu ginec贸logo el motivo del cambio. Me imagino que estar谩 reconsiderando la preparaci贸n endometrial diferente cara a la transferencia embrionaria con un ciclo natural modificado, pero no puedo saber lo que ha pensado.
      Siento no poder darte m谩s informaci贸n.
      Un saludo.

      1. Buenas tardes, Me realic茅 el test META de DINAScience que es equivalente a EMMA/ALICE. Sali贸 presencia de estreptococo y 75% lactobacilus. Me pautaron 1 semana antibi贸tico (ampicilina) y probi贸ticos orales y vaginales durante 2-3 meses. No me han recomendado repetir la prueba pero ser铆a conveniente hacerlo aunque sea por cultivo o CD138? Cuanto es recomendable esperar para repetir la prueba tras finalizar antibi贸tico? Muchas gracias

        1. Buenas tardes, normalmente es el laboratorio el que indica si es necesario o no repetir la prueba, si existe duda yo hablo personalmente del caso con los microbi贸logos para que me den su opini贸n.
          El estudio de CD 138 es una prueba inferior a la realizada por ellos de la microbiota por NGS.
          Tras los antibi贸ticos se recomienda esperar 4 semanas.
          Un saludo.

  6. Hola Doctor .
    Estoy muy interesado en que hagamos los test con mi esposa
    En la empresa de medicina privada me piden alguna gu矛a que emita recomendaci貌n sobre la t猫cnica para pagarme el procedimiento.
    驴Sabe de alguna ?

  7. Muchas gracias por su respuesta. Voy a repetir el test EMMA y hacer en la misma biopsia el CD138. Si el test EMMA sale bien pero el CD138 sale positivo, 驴ser铆a conveniente tomar antibi贸ticos? 驴O mejor tener solo en cuenta el test EMMA? Muchas gracias!

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